编制和管理不同
公务员：公务员都是国家行政编制，按照《国家公务员管理条例》管理。
事业单位：事业单位都是事业单位编制。其中，
参公事业单位按照《国家公务员管理条例》管理；
普通事业单位按照《事业单位人事管理条例》管理。
分类不同
公务员：公务员职位按职位的性质、特点和管理需要，划分为综合管理类、专业技术类和行政执法类等类别。国务院根据中华人民共和国公务员法，对于其职位特殊性，需单独管理的，可增设其他职位类别。
事业单位：根据招考来源不同分为参公事业单位和普通事业单位；根据社会功能将现有事业单位划分为承担行政职能、从事生产经营活动和从事公益服务三个类别
收入来源不同
公务员：公务员的工资福利由国家财政负担。
事业单位：事业单位的工资福利根据资金来源不同分为了国家全额拨款事业单位、差额拨款事业单位、自主事业单位。
全额拨款事业单位：工资福利由国家财政全部负担，例如学校、科研单位等；
差额拨款事业单位：工资福利由国家财政承担部分，由单位承担部分，例如医院；
自主事业单位：国家不拨款的事业单位，收支自己支付。
